。播州之役：李化龙平定杨应龙，设遵义府。
万历二十九年，三十六岁。立太子：朱常洛终被立为皇太子；利玛窦定居北京。
万历三十年，三十七岁。神宗病中欲废矿税，愈后反悔；荷兰东印度公司成立。
万历三十一年，三十八岁。妖书案：诬太子谋反文字狱；泉州大地震死伤数万。
万历三十二年，三十九岁。黄河决口淹没徐州；东林党人顾宪成讲学议政。
万历三十三年，四十岁。北京大旱致蝗灾；利玛窦《坤舆万国全图》刊行。
万历三十四年，四十一岁。云南民变杀税监杨荣；努尔哈赤灭辉发部。
万历三十五年，四十二岁。辽东大水灾；努尔哈赤灭乌拉部，统一女真大部。
万历三十六年，四十三岁。江南抗税民变：葛贤率苏州织工反太监孙隆。
万历三十七年，四十四岁。辽东总兵李成梁弃宽甸六堡；荷兰占澎湖。
万历三十八年，四十五岁。黄河决口淹没泗州明祖陵；西洋传教士熊三拔入京。
万历三十九年，四十六岁。李三才遭弹劾去职（东林党争激化）；山东白莲教起义。
万历四十年，四十七岁。辽东旱灾人相食；努尔哈赤征蒙古科尔沁部。
万历四十一年，四十八岁。梃击案：男子持棍闯东宫谋害太子，党争白热化。
万历四十二年，四十九岁。福王朱常洵就藩洛阳；李之藻译《同文算指》。
万历四十三年，五十岁。努尔哈赤建八旗制度；山东白莲教首徐鸿儒起义。这一年，英国公上疏言蒙古边事，神宗回复交由部议即可，这也是他这一生唯一一次上疏言及边事。
万历四十四年，五十一岁。后金建国：努尔哈赤称汗（2月），年号天命，明朝承认其国书。
万历四十五年，五十二岁。山东大饥荒；后金征黑龙江萨哈连部。
万历四十六年，五十三岁。后金攻明：努尔哈
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